Komatsuzaki Group

Chun Biu LI(李 振風)

准教授
  1. 電子科学研究所 附属社会創造数学研究センター データ数理研究分野 准教授
  2. 理学部数学科 准教授 兼任
E-mail:
cbli(at)es.hokudai.ac.jp
FAX:
(+81)11-706-9437
居室:
電子科学研究所 5階 103-2
住所:
〒001-0020 
札幌市北区北20条西10丁目 電子科学研究所 附属社会創造数学研究センター データ数理研究分野

Full CV

CV_ChunBiu_201604

研究の興味

私の研究課題は、自然界の複雑な現象を明らかにすることである。
とりわけ生物学的のめざましい発展は、われわれに数多くの独特な非線形複雑系を研究対象として提供してきた。それらの非線形複雑系においては、動力学が「生命のアルゴリズム」を実装し、複雑で変動する環境の中で生き残るために必須な機能を体現している。

しかしこれらの系は非常に複雑な性質を持ち、さらに集団の中で平均されない一分子の動力学だけを観測することが難しい。そのため、細胞膜と細胞小器官におけるたんぱく質の機能、エネルギー貯蔵、輸送特性といった生体分子の基礎的・非線形的現象についての現在の動力学的理解は、解剖学あるいはあらかじめ仮定されたミクロレベルにおける自由エネルギー地形による熱力学的描像を超えていない。

この新しい動力学的方法論を開発したり、最近研究が進んでいる非線形力学、情報理論、非平衡統計学を用いることによって、生物システムの統合的・定量的な理解を進め、生命の源と意味に新しい光を当てたいと考えている。

最近の研究テーマ

  • 非線形時系列解析
    1分子計測とMDシュミレーションから、たんぱく質折れ畳みのダイナミックス・機能・構造を理解する。情報理論・ネットワーク理論・非線形力学・非平衡統計力学に基づいて、非線形で非定常な時系列を解析するための新しい方法を開発する。
    生物学の新しいシステムにおける、時空間構造の階層的な特性を抽出する。例)情報の流れ、因果関係、各粗視化レベルでのダイナミックス、コヒーレント構造。
  • 反応動力学の理論
    一方向の(軌道の再交差を与えない)遷移状態の存在とエルゴード性の妥当性など、化学反応理論の基本的仮説の研究。
    遷移ダイナミックスにおける階層性をあきらかにする(分岐やカオス的な現象)。
    化学反応を媒介する幾何学的な構造の抽出、たとえば多次元位相空間における反応動力学を支配している不変多様体ないしは経路。
  • 非平衡統計力学と非線形力学
    創発的・自己組織的な構造とパターン形成のような、複雑な現象を理解するため、要素還元主義を超えて分布関数及び確率概念に基づく新しい理論的枠組みを開発する。
    可逆的な微視的ダイナミックスと不可逆な巨視的な世界とを橋渡しするための、統計力学の再公式化。

最近の代表的な論文・書籍

書籍

2017

[2]Meysam Tavakoli, J. Nicholas Taylor, Chun-Biu Li, Tamiki Komatsuzaki, Steve Pressé
Advances in Chemical Physics: "Single Molecule Data Analysis: An Introduction" Edited by Stuart A. Rice, Aaron R. Dinner (Wiley)

2011

[1]Chun Biu Li, Tamiki Komatsuzaki
Extracting the Underlying Unique Reaction Scheme from a Single-Molecule Time Series in Cell Signaling Reactions: Single-Molecular Kinetic Analysis (Springer) , ISBN: 978-90-481-9863-4
(invited)

論文

2016

[42]Satoru Tsugawa, Nathan Hervieux, Olivier Hamant, Arezki Boudaoud, Richard S. Smith, Chun-Biu Li, Tamiki Komatsuzaki
Extracting subcellular fibrillar alignment with error estimation: Application to microtubules
Biophysical Journal 110(8), pp.1836-1844 (2016)
DOI: 10.1016/j.bpj.2016.03.011

2015

[41]C.B. Li, H. Ueno, R. Watanabe, H. Noji, T. Komatsuzaki
ATP hydrolysis assists phosphate release and promotes reaction ordering in F1-ATPase
Nature Communications 6(10223), (2015)
DOI: 10.1038/ncomms10223

[40]Chun Biu Li
Challenges in Constructing State-Space Network Models for Complex Systems at the Single Molecule Level
ASTE; Advances in Science, Technology and Environmentology, Special issue on New Challenges in Complex Systems Science B11, pp.51-54 (2015)

2014

[39]Chun-Biu Li, Tamiki Komatsuzaki
Handling Noisy Data from Single Molecule Experiments
SEIBUTSU BUTSURI 54(5), pp.257-258 (2014)
DOI: 10.2142/biophys.54.257

[38]Preetom Nag, Hiroshi Teramoto, Chun-Biu Li, Joseph Z. Terdik, Norbert F. Scherer, Tamiki Komatsuzaki
Local-heterogeneous responses and transient dynamics of cage breaking
The Journal of Chemical Physics 141, pp.104907-1-104907-12 (2014)
DOI: 10.1063/1.4894866

2013

[37]Tahmina Sultana, Hiroaki Takagi, Miki Morimatsu, Hiroshi Teramoto, Chun-Biu Li, Yasushi Sako, Tamiki Komatsuzaki
Non-Markovian properties and multiscale Hidden Markovian Network Buried in Single Molecule Time Series
The Journal of Chemical Physics 139, pp.245101-245101-12 (2013)
DOI: 10.1063/1.4848719
This paper was chosen as one of the most-accessed articles in Biological Molecules and Networks from The Journal of Chemical Physics.

[36]Yasuhiro Matsunaga, Akinori Baba, Chun Biu Li, John Straub, Mikito Toda, Tamiki Komatsuzaki, R. Stephen Berry
Spatio-temporal hierarchy in the dynamics of a minimalist protein model
The Journal of Chemical Physics 139, pp.215101-215101-13 (2013)
DOI: 10.1063/1.4834415

[35]Yutaka Nagahata, Hiroshi Teramoto, Chun-Biu Li, Shinnosuke Kawai, Tamiki Komatsuzaki
Reactivity boundaries for chemical reactions associated with higher index and multiple saddles
Physical Review E 88(4), pp.42923-42923-11 (2013)
DOI: 10.1103/PhysRevE.88.042923
(Figure 6d from this paper was selected to be displayed on PRE journal web site as part of "Kaleidoscope")

[34]Chun-Biu Li, Tamiki Komatsuzaki
Aggregated Markov Model Using Time Series of Single Molecule Dwell Times with Minimum Excessive Information
Physical Review Letters 111, pp.58301-58301-5 (2013)
DOI: 10.1103/PhysRevLett.111.058301

[33]Yutaka Nagahata, Hiroshi Teramoto, Chun-Biu Li, Shinnosuke Kawai, Tamiki Komatsuzaki
Reactivity Boundaries to Separate the Fate of a Chemical Reaction Associated with an Index-two saddle
Physical Review E 87(6), pp.62817 , (2013)
DOI: 10.1103/PhysRevE.87.062817

[32]Tatyana Terentyeva, Johan Hofkens, Tamiki Komatsuzaki, Kerstin Blank, Chun-Biu Li
Time-Resolved Single Molecule Fluorescence Spectroscopy of an α-Chymotrypsin Catalyzed Reaction
Journal of Physical Chemistry B 117 (5), pp.1252-1260 (2013)
DOI: 10.1021/jp310663v

2012

[31]Tatyana Terentyeva, Hans Engelkamp, Alan Rowan, Tamiki Komatsuzaki, Johan Hofkens, Chun Biu Li, Kerstin Blank
Dynamic Disorder in Single Enzyme Experiments: Facts and Artifacts
ACS Nano 6(1), pp.346-354 (2012)
DOI: 10.1021/nn203669r
(Chosen as a highlighted article In Nano, Volume 6, issue 1(2012))

2011

[30]Naoki Miyagawa, Hiroshi Teramoto, Chun-Biu Li, Tamiki Komatsuzaki
Decomposability of Multivariate Interactions
Complex Systems 20, pp.165-179 (2011)

[29]Naoki Miyagawa, Hiroshi Teramoto, Chun-Biu Li, Tamiki Komatsuzaki
Spatial Heterogeneity of Multivariate Dependence
AIP Conference Proceedings ''International Conference of Numerical Analysis and Applied Mathematics 2011'' 1389, pp.991-991 (2011)

[28]David M. Leitner, Yasuhiro Matsunaga, Akira Shojiguchi, Chun-Biu Li, Tamiki Komatsuzaki, Mikito Toda
Non-Brownian Phase Space Dynamics of Molecules, the Nature of their Vibrational States, and non-RRKM Kinetics
Advances in Chemical Physics 145, pp.83-122 (2011)

[27]Shinnosuke Kawai, Hiroshi Teramoto, Chun-Biu Li, Tamiki Komatsuzaki, Mikito Toda
Dynamical Reaction Theory based on Geometric Structures of Phase Space
Advances in Chemical Physics 145, pp.123-170 (2011)

2010

[26]Tamiki Komatsuzaki, Chun Biu Li, Shinnosuke Kawai
Robustness and Diversity of Transitions in a Sea of Chaos and Stochastic Fluctuation
AIP Conference Proceedings "International Conference of Numerical Analysis and Applied Mathematics 2010" 1281(1), pp.1582-1584 (2010)

[25]Yasuhiro Matsunaga, Chun Biu Li, Tamiki Komatsuzaki
Collectivity at Different Space and Time Scales in Multiscale Protein Dynamics
Physical Review E 82, pp.016213, (2010)
This paper was selected in "Virtual Journal of Biological Physics Research "Protein Conformational Dynamics/Folding " 20(3) (2010)".

2009

[24]Chun Biu Li, Mikito Toda, Tamiki Komatsuzaki
Bifurcation of no-return transition states in many-body chemical reactions
Journal of Chemical Physics 130, pp.124116, (2009)

[23]Chun Biu Li, Haw Yang, Tamiki Komatsuzaki
New Quantification of Local Transition Heterogeneity of Multiscale Complex Networks Constructed from Single-Molecule Time Series
Journal of Physical Chemistry B 113(44), pp.14732-14741 (2009)

2008

[22]Akira Shojiguchi, Chun Biu Li, Tamiki Komatsuzaki, Mikito Toda
Erratum: Fractional Behavior in Multi-Dimensional Hamiltonian Systems Describing Reactions
Physical Review E 77, pp.019902, (2008)

[21]Chun Biu Li, Haw Yang, Tamiki Komatsuzaki
Multiscale Complex Network of Protein Conformational Fluctuation Buried in Single Molecule Time Series
Proceedings of National Academy of Sciences USA 105, pp.536-541 (2008)
This paper was selected in "Virtual Journal of Biological Physics Research "Single Molecule Dynamics", 15(3) (2008)"

[20]Akira Shojiguchi, Chun Biu Li, Tamiki Komatsuzaki, Mikito Toda
Dynamical Foundation and Limitations of Statistical Reaction Theory
Communications in Nonlinear Science and Numerical Simulation 13, pp.857-657 (2008)

2007

[19]Akira Shojiguchi, Chun Biu Li, Tamiki Komatsuzaki, Mikito Toda
Fractional Behavior in Multi-Dimensional Hamiltonian Systems Describing Reactions
Physical Review E 76, pp.056205(1)-056205(14) (2007)

[18]Yasuhiro Matsunaga, Chun Biu Li, Tamiki Komatsuzaki
Anomalous Diffusion in Folding Dynamics on Minimalist Protein Landscape
Physical Review Letters 99, pp.238103, (2007)
This paper was selected in "Virtual Journal of Biological Physics Research "Protein Conformational Dynamics/Folding " 14(12)(2007)".

[17]Akira Shojiguchi, Chun Biu Li, Tamiki Komatsuzaki, Mikito Toda
'Fractional behavior in nonergodic reaction processes of isomerization
Physical Review E (rapid communication) 75, pp.035204(R), (2007)

[16]Shinnosuke Kawai, Yo Fujimura, Okitsugu Kajimoto, Takefumi Yamashita, Chun-Biu Li, Tamiki Komatsuzaki, Mikito Toda
Dimension reduction for extracting geometrical structure of multidimensional phase space: Application to fast energy exchange in the reaction O(1D)+N2O →NO+NO
Physical Review A 75, pp.022714, (2007)

2006

[15]Gareth J. Rylance, Roy L. Johnston, Yasuhiro Matsunaga, Chun Biu Li, Akinori Baba, Tamiki Komatsuzaki
Topographical complexity of multidimensional energy landscapes
Proceedings of National Academy of Sciences USA 103, pp.18551, (2006)
This paper was selected in "Virtual Journal of Biological Physics Research "Protein Conformational Dynamics/Folding " 12(12) (2006)".

[14]Chun Biu Li, Akira Shojiguchi, Mikito Toda, Tamiki Komatsuzaki
Erratum: Dynamical Hierarchy in Transition States of Reactions
Few-Body Systems 40, pp.129-129 (2006)

[13]Chun Biu Li, Akira Shojiguchi, Mikito Toda, Tamiki Komatsuzaki
Erratum: Definability of No-Return Transition States in the High-Energy Regime above the Reaction Threshold [Phys. Rev. Lett. 97, 028302 (2006)]
Physical Review Letters 97, pp.129901, (2006)

[12]Akira Shojiguchi, Akinori Baba, Chun Biu Li, Tamiki Komatsuzaki, Mikito Toda
Wavelet Analysis and Arnold Web Picture for Detecting Energy Transfer in Hamiltonian Dynamical System
Laser Physics 16(7), pp.1097-1106 (2006)

[11]Chun Biu Li, Akira Shojiguchi, Mikito Toda, Tamiki Komatsuzaki
Definability of No-return Transition States in High Energy Regime Above Threshold
Physical Review Letters 97, pp.028302-028305 (2006)

[10]Chun Biu Li, Akira Shojiguchi, Mikito Toda, Tamiki Komatsuzaki
Dynamical Hierarchy in Transition States of Reactions
Few-Body Systems 38, pp.173-179 (2006)

[9] Chun Biu Li, M. Toda, T. Komatsuzaki
Geometrical Structure buried in the Phase Space of Stochastic Structural Transition 物性研究 86(1), pp.77-81 (2006)

2005

[8]Chun Biu Li, Yasuhiro Matsunaga, Mikito Toda, Tamiki Komatsuzaki
Phase Space Reaction Network on a Multisaddle Energy Landscape: HCN isomerization
Journal of Chemical Physics 123, pp.184301(1)-184301(13) (2005)

[7] Chun Biu Li, M. Toda, T. Komatsuzaki
Chaotic Reaction Dynamics and the Phase Space Geometry of Multidimensional Chemical Reaction
物性研究 84(3), pp.481-482 (2005)

2004

[6]C.B. Li, D.J. Driebe, T. Petrosky
Resonance Overlap, Secular Effects and Non-integrability: An Approach from Ensemble Theory
Physical Review E 69, pp.066120, (2004)

[5]H.H. Hasegawa, C.B. Li, Y. Ohtaki
Thermodynamics of a system with long-time correlations
International Journal of Quantum Chemistry 98, pp.138, (2004)

2003

[4]H.H. Hasegawa, D.J. Driebe, C.B. Li
Spectral decomposition of stretching dynamics of Arnold cat map
Physics Letters A 319(3-4), pp.290, (2003)

[3]H.H. Hasegawa, C.B. Li, Y. Ohtaki
Fractional power scaling of excess heat production
Physics Letters A 307, pp.222, (2003)

1997

[2]C.B. Li, D.C. Mattis
t-J Model with infinite-ranged hopping
Modern Physics Letters B 11(4), pp.115, (1997)

1995

[1]C.F. Lo, T.Y. Liu, C.B. Li
Squeezing properties of a pulsating oscillator
Quantum Semiclassical Optics 7, pp.843, (1995)

国内発表

2016

[132]Nag Preetom, Khalifa Helal, Teramoto Hiroshi, Yamaguchi Naoya, Li Chun-Biu, Haga Hisashi, Komatsuzaki Tamiki
Spatial heterogeneous and transient dynamics during collective cell migration in a monolayer of MDCK epithelial cells 第54回日本生物物理学会年会
(11.25-11.27 ,2016), つくば国際会議場 茨城県つくば市 (ポスター) ( 発表日: 2016.11. 26)

[131]Chun Biu Li
Single Molecule Time Series Analyses of F1-ATPase to Unveil the Roles of ATP Hydrolysis 分子研研究会「超機能分子の創成-合成、計測、数理が織りなす社会実装分子の戦略的設計と開発-」
(6.27-6.28 ,2016), 岡崎コンファレンスセンター 愛知県岡崎市 (招待, 口頭) ( 発表日: 2016.6. 27)

[130]Chun-Biu Li, Hiroshi Ueno, Rikiya Watanabe, Hiroyuki Noji, Tamiki Komatsuzaki
The key and unlock mechanisms in F1-ATPase unveiled by single molecule time series analysis 新学術領域「少数性生物学」 研究成果報告会
(3.15 ,2016), 東京大学 伊藤謝恩ホール 東京都文京区 (ポスター) ( 発表日: 2016.3. 15)

[129]津川 暁, Chun Biu Li, 小松崎 民樹
On the Relationship between Local Microtubule and Cell Growth in Plants Mathematical Sciences Evening Seminar
( ,2016), 北海道大学遠友学舎 北海道札幌市 (口頭) ( 発表日: 2016.2. 19)

[128]津川 暁, Chun Biu Li, 小松崎 民樹
Correlated Oscillation in Microtubule Fluctuation and Cell Growth in Arabidopsis Sepal 第132回植物科学セミナー
( ,2016), 理学部5号館8階813号室 北海道札幌市 (口頭) ( 発表日: 2016.1. 25)

2015

[127]永幡 裕, 前田 理, 寺本 央, Chun-Biu Li, 武次 徹也, 小松崎 民樹
マルコフ連鎖の時間階層的クラスタリング ERATO湊離散構造処理系プロジェクト 「2015年度 秋のワークショップ」
(11.8-11.10 ,2015), 丸駒温泉 北海道千歳市 (口頭) ( 発表日: 2015.11. 8)

[126]津川 暁, Chun Biu Li, 小松崎 民樹
細胞内レベルでの微小管配向の抽出 「理論と実験」研究会2015 in 広島大学
(10.8-10.9 ,2015), 広島大学東広島キャンパス 広島県東広島市 (口頭) ( 発表日: 2015.10. 9)

[125]田宮 裕治, Chun Biu Li, 渡邉 力也, 野地 博行, 小松崎 民樹
The temperature dependence and non-equilibrium properties of the single F1-ATPase kinetics 「理論と実験」研究会2015 in 広島大学
(10.8-10.9 ,2015), 広島大学東広島キャンパス 広島県東広島市 (口頭) ( 発表日: 2015.10. 8)

[124]田宮 裕治, Chun-Biu Li, 渡邉 力也, 野地 博行, 小松崎 民樹
非平衡効果が引き起こすF1分子モーターの非アレニウス型温度依存性 第9回分子化学討論会
(9.16-9.19 ,2015), 東京工業大学大岡山キャンパス 東京都目黒区 (ポスター) ( 発表日: 2015.9. 17)

[123]永幡 裕, 前田 理, 寺本 央, Chun-Biu Li, 堀山 貴史, 武次 徹也, 小松崎 民樹
複雑分子系の異性化反応ネットワークに埋め込まれた時間階層構造の解読 第9回分子化学討論会
(9.16-9.19 ,2015), 東京工業大学 大岡山キャンパス 東京都目黒区 (ポスター) ( 発表日: 2015.9. 16)

[122]Yutaka Nagahata, Satoshi Maeda, Hiroshi Teramoto, Chun-Biu Li, Takashi Horiyama, Tetsuya Taketsugu, Tamiki Komatsuzaki
複雑反応ネットワークに埋め込まれた時間階層構造の解読 第53回日本生物物理学会
(9.13-9.15 ,2015), 金沢大学角間キャンパス自然科学本館 石川県金沢市 (ポスター) ( 発表日: 2015.9. 14)

[121]Satoru Tsugawa, Chun-Biu Li, Tamiki Komatsuzaki
植物の中の局所微小管と細胞成長の関係について 第53回日本生物物理学会
(9.13-9.15 ,2015), 金沢大学角間キャンパス自然科学本館 石川県金沢市 (ポスター) ( 発表日: 2015.9. 13)

[120]Yuji Tamiya, Chun-Biu Li, Rikiya Watanabe, Hiroyuki Noji, Tamiki Komatsuzaki
非平衡効果が引き起こすF1分子モーターの非アレニウス型温度依存性 第53回日本生物物理学会
(9.13-9.15 ,2015), 金沢大学角間キャンパス自然科学本館 石川県金沢市 (ポスター) ( 発表日: 2015.9. 13)

[119]Chun-Biu Li, Tamiki Komatsuzaki
Single Molecule Time Series Analysis of F1-ATPase to Unravel the Role of Bound-ATP Hydrolysis 第53回日本生物物理学会
(9.13-9.15 ,2015), 金沢大学角間キャンパス自然科学本館 石川県金沢市 (口頭) ( 発表日: 2015.9. 13)

[118]永幡 裕, 前田 理, 寺本 央, Chun-Biu Li, 武次 徹也, 小松崎 民樹
複合化学反応系の分子シミュレーション-第一原理シミュレーションから分子技術へ- 化 学 反 応 経 路 探 索 の ニ ュ ー フ ロ ン ティ ア
(9.15 ,2015), 大井町駅前品川区立総合区民会館きゅりあん1F 小ホール 東京都大井町 (口頭) ( 発表日: 2015.9. 15)

[117]永幡 裕, 前田 理, 寺本 央, Chun-Biu Li, 堀山 貴史, 武次 徹也, 小松崎 民樹
複雑な異性化反応ネットワークに埋め込まれた時間階層構造の解読法の開発 日本化学会北海道支部 2015年 夏季研究発表会
(7.18 ,2015), 北海道教育大学函館校 北海道函館市 (口頭) ( 発表日: 2015.7. 18)

[116]田宮 裕治, Chun-Biu Li, 渡邉 力也, 野地 博行, 小松崎 民樹
Sumi-Marcus 型ポテンシャルモデルを用いた F1分子モーターの反応速度定数の解析 日本化学会北海道支部 2015年 夏季研究発表会
(7.18 ,2015), 北海道教育大学函館校 北海道函館市 (口頭) ( 発表日: 2015.7. 18)

[115]永幡 裕, 前田 理, 寺本 央, Chun-Biu Li, 武次 徹也, 小松崎 民樹
マルコフ連鎖の時間階層的クラスタリング ERATO湊離散構造処理系プロジェクト 「2015年度 初夏のワークショップ」
(6.11-6.12 ,2015), 北海道大学情報科学研究科 ERATO 会議室 北海道札幌市 (ポスター) ( 発表日: 2015.6. 11)

[114]冨樫 祐一, 小松崎 民樹, 李 振風, 寺本 央, 新海 創也, Holger Flechsig, James Nick Taylor, 中川 正基
少数分子反応ネットワーク理論の構築 (7) 新学術領域「少数性生物学」第9回領域会議
(6.5-6.7 ,2015), 万国津梁館 沖縄県名護市 (口頭) ( 発表日: 2015.6. 6)

[113]津川 暁, Chun Biu Li, 小松崎 民樹
蛍光画像から微小管配向構造の抽出 早稲田大学相澤研究室研究会
(4.25 ,2015), 早稲田大学西早稲田キャンパス 東京都新宿区 (招待, 口頭) ( 発表日: 2015.4. 25)

[112]津川 暁, Chun Biu Li, 小松崎 民樹
蛍光画像から微小管配向構造を抽出する方法について 理研シンポジウム「細胞システムの動態と論理 Ⅶ」
(4.2-4.3 ,2015), 独立行政法人理化学研究所 生物科学研究棟 埼玉県和光市 (口頭) ( 発表日: 2015.4. 3)

[111]田宮 裕治, Chun Biu Li, 渡邉 力也, 野地 博行, 小松崎 民樹
F1 分子モーターの温度依存性 理研シンポジウム「細胞システムの動態と論理 Ⅶ」
(4.2-4.3 ,2015), 独立行政法人理化学研究所 生物科学研究棟 埼玉県和光市 (口頭) ( 発表日: 2015.4. 2)

[110]冨樫 祐一, 小松崎 民樹, 李 振風, 寺本 央, 新海 創也
少数分子反応ネットワーク理論の構築 (4) 新学術領域研究「少数性生物学」第8回領域会議
(1.29-2.1 ,2015), ルスツリゾート 虻田郡留寿都村 (口頭) ( 発表日: 2015.1. 30)

[109]J. Nick Taylor, Chun Biu Li, Tamiki Komatsuzaki
Data Scientific Approaches to the Quantification and Interpretation of Raman Microscopic Images of Living Cells 新学術領域研究「少数性生物学」第8回領域会議
(1.29-2.1 ,2015), ルスツリゾート 虻田郡留寿都村 (ポスター) ( 発表日: 2015.1. 29)

[108]Chun-Biu Li
Single Molecule Time Series Analysis of F1-ATPase to Unravel the Role of ATP Hydrolysis and Thermal Fluctuations 新学術領域研究「少数性生物学」第8回領域会議
(1.29-2.1 ,2015), ルスツリゾート 虻田郡留寿都村 (ポスター) ( 発表日: 2015.1. 29)

[107]永幡 裕, 寺本 央, Chun-Biu Li, 小松崎 民樹
Developing “hierarchical” spectral clustering decoded by the mathematical nature of a Markov chain: - timescale hierarchical nature of isomerization reaction network of C5H8O - 河原林/湊プロジェクト合同WS予餞会Winter2015
(1.23-1.24 ,2015), 日本科学未来館 東京都江東区 (ポスター) ( 発表日: 2015.1. 23)

[106]永幡 裕, 寺本 央, 堀山 貴史, Chun-Biu Li, 小松崎 民樹
Markov連鎖の持つ時間階層構造について:複雑分子系の異性化反応ネットワークを例に 非平衡ダイナミクスセミナー
(1.15 ,2015), 奈良女子大学 奈良県奈良市 (招待, 口頭) ( 発表日: 2015.1. 15)

2014

[105]永幡 裕, 前田 理, 寺本 央, Chun-Biu Li, 堀山 貴史, 武次 徹也, 小松崎 民樹
複雑分子系の構造異性化反応ネットワークに埋め込まれた時間階層構造の抽出  研究会「理論と実験」2014
(10.9-10.10 ,2014), 広島大学理学部 広島県東広島市 (口頭) ( 発表日: 2014.10. 10)

[104]Nag Preetom, 寺本 央, Chun-Biu Li, 小松崎 民樹
Dynamical heterogeneity and dynamics of cage breaking and formation in colloidal fluids 第52回日本生物物理学会年会
(9.25-9.27 ,2014), 札幌コンベンションセンター 北海道札幌市 (ポスター) ( 発表日: 2014.9. 25)

[103]永幡 裕, 前田 理, 寺本 央, Chun-Biu Li, 堀山 貴史, 武次 徹也, 小松崎 民樹
複雑分子系の異性化反応ネットワークに埋め込まれた時間階層構造の抽出 第52回日本生物物理学会年会
(9.25-9.27 ,2014), 札幌コンベンションセンター 北海道札幌市 (ポスター) ( 発表日: 2014.9. 27)

[102]永幡 裕, 前田 理, 寺本 央, Chun-Biu Li, 堀山 貴史, 武次 徹也, 小松崎 民樹
複雑分子系の異性化反応ネットワークに埋め込まれた時間階層構造の抽出 第8回分子科学討論会
(9.21-9.24 ,2014), 広島大学東広島キャンパス 広島県東広島市 (口頭) ( 発表日: 2014.9. 21)

[101]田宮 裕治, Chun-Biu Li, 渡邉力也, 野地博行, 小松崎民樹
F1 分子モーターにおける温度依存性の高い反応段階について 北大理論化学合同Workshop
(9.1 ,2014), 創成科学研究棟 4階セミナー室 北海道札幌市 (口頭) ( 発表日: 2014.9. 1)

[100]永幡 裕, 前田 理, 寺本 央, Chun-Biu Li, 堀山 貴史, 武次 徹也, 小松崎 民樹
複雑分子系に埋め込まれた時間階層構造が映す化学分野の“非常識” ERATO湊離散構造処理系プロジェクト 「2014年度 秋のワークショップ」
(9.7-9.10 ,2014), ピスカ21  北海道礼文島 (ポスター) ( 発表日: 2014.9. 9)

[99]田宮 裕治, Chun-Biu Li, 渡邉 力也, 野地 博行, 小松崎 民樹
数学の力で読み解く一分子時系列〜F1分子モーターを題材として〜 第54回 生物物理若手の会 夏の学校
(8.8-8.11 ,2014), ホテルたつき 愛知県蒲郡市 (ポスター) ( 発表日: 2014.8. 9)

[98]Chun Biu Li
Error-based Extraction of Effective Free Energy Landscapes from Single Molecule Time-Series 新学術領域「少数性生物学」第7回領域会議
(6.21-6.22 ,2014), 琵琶湖クラブ 滋賀県大津市 (ポスター) ( 発表日: 2014.6. 21)

[97]永幡 裕, 前田 理, 寺本 央, Chun Biu Li, 堀山 貴史, 武次 徹, 小松崎 民樹
複雑分子系における構造異性化反応ネットワークの理解に向けて 第17回理論化学討論会
(5.22-5.24 ,2014), 名古屋大学(東山キャンパス)ES総合館 愛知県名古屋市 (口頭) ( 発表日: 2014.5. 23)

[96]永幡 裕, 前田 理, 寺本 央, Chun-Biu Li, 堀山 貴史, 武次 徹也, 小松崎 民樹
Markov連鎖が持つ時間階層構造抽出に向けて- 階層間をつなぐ理論の構築と、複雑な反応系の解析に向けて - JST ERATO湊離散構造処理系プロジェクト セミナー
(4. 30 ,2014), 北海道大学工学部 北海道札幌市 (招待, 口頭) ( 発表日: 2014.4. 30)

[95]永幡 裕, 寺本 央, Chun-Biu Li, 小松崎 民樹
タンパク質の時系列から得られたMarkov連鎖の解析に向けて:具体的な反応ネットワークの解析結果とその数値的な振る舞い ERATO湊離散構造処理系プロジェクト 「2014年度 春のワークショップ」
(4.18-4.19 ,2014), 北海道大学工学部 北海道札幌市 ( 発表日: 2014.4. 18)

[94]永幡 裕, 寺本 央, 堀山 貴史, Chun-Biu Li, 小松崎 民樹
タンパク質の時系列から得られたMarkov連鎖の解析に向けて:グラフの分割とクラスタリングで定義する複雑な化学反応における状態とその時間階層構造 理研シンポジウム:細胞システムの動態と論理Ⅵ
(4. 3-4. 4 ,2014), 理化学研究所和光本所 埼玉県和光市 (口頭/ポスター) ( 発表日: 2014.4. 3・4)

[93]永幡 裕, 寺本 央, 李 振風, 小松崎 民樹
タンパク質一分子計測から得られたマルコフ連鎖がもつ時間階層構造の理解に向けて 日本物理学会 第69回年次大会
(3. 27-3. 30 ,2014), 東海大学湘南キャンパス 神奈川県平塚市 (口頭) ( 発表日: 2014.3. 30)

[92]宮川 尚紀, 寺本 央, 河合 信之輔, 李 振風, 小松崎 民樹
パターン形成における本質的な高次相関情報量の抽出 日本物理学会 第69回年次大会
(3. 27-3. 30 ,2014), 東海大学湘南キャンパス 神奈川県平塚市 (口頭) ( 発表日: 2014.3. 28)

[91]寺本 央, Preetom Nag, Chun Biu Li, 小松崎 民樹
Dynamical heterogeneity and cage breaking dynamics in colloidal fluids in terms of Lagrangian Coherent structures (LCSs) 2013 年度日本生物物理学会北海道支部例会
(3.10 ,2014), 北海道大学 シオノギ創薬イノベーションセンター 北海道札幌市 (口頭) ( 発表日: 2014.3. 10)

[90]寺本 央, Preetom Nag, Chun Biu Li, 小松崎 民樹
Extracting coherent dynamics in colloidal fluids in terms of Lagrangian Coherent structures (LCSs) International Life-Science Symposium
(3.6 ,2014), 北海道大学 理学部 北海道札幌市 (口頭) ( 発表日: 2014.3. 6)

[89]永幡 裕, 堀山 貴史, 前田 理, 寺本 央, Chun Biu Li, 小松崎 民樹
タンパク質の時系列から得られたMarkov連鎖の解析に向けて:グラフの分割とクラスタリングで定義する複雑な化学反応における状態とその時間階層構造 2013 年度日本生物物理学会北海道支部例会
(3. 10 ,2014), 北海道大学 シオノギ創薬イノベーションセンター 北海道札幌市 (口頭) ( 発表日: 2014.3. 10)

[88]冨樫 祐一, 小松崎 民樹, 李 振風, 寺本 央, 新海 創也
少数分子反応ネットワーク理論の構築 新学術領域研究「少数性生物学」第6回領域会議
(2. 20-2. 23 ,2014), ヒルトンニセコビレッジ 北海道ニセコ (口頭) ( 発表日: 2014.2. 21)

[87]Chun Biu Li, Tamiki Komatsuzaki
Constructing Kinetic Scheme Objectively from Dwell-Time Time Series with Exact Information Content 新学術領域研究「少数性生物学」第6回領域会議
(2. 20-2. 23 ,2014), ヒルトンニセコビレッジ 北海道ニセコ (ポスター) ( 発表日: 2014.2. 21)

[86]J. Nick Taylor, Chun Biu Li, Tamiki Komatsuzaki
Extracting the Underlying Free Energy Landscape Buried in Photon-by- Photon based Single-Molecule Measurements 新学術領域研究「少数性生物学」第6回領域会議
(2. 20-2. 23 ,2014), ヒルトンニセコビレッジ 北海道ニセコ (ポスター) ( 発表日: 2014.2. 21)

[85]寺本 央, Preetom Nag, Chun Biu Li, 小松崎 民樹
コロイド流体の動的協同運動のLagrangian Coherent Structureによる抽出 北海道大学電子科学研究所平成25年度研究交流会
(1. 10 ,2014), 北海道大学, 電子科学研究所1階セミナールーム 北海道札幌市 (ポスター) ( 発表日: 2014.1. 10)

2013

[84]永幡 裕, 寺本 央, 堀山 貴史, Chun Biu Li, 小松崎 民樹
タンパク質一分子の計測から得られた定常マルコフ連鎖がもつ時間階層構造の理解に向けて ERATO湊離散構造処理系プロジェクト 「2013年度 秋のワークショップ」
(11. 25-11. 27 ,2013), 第一滝本館  北海道登別市 (ポスター) ( 発表日: 2013.11. 25)

[83]J. Nick Taylor, Li Chun-Biu, Kawai Shinnosuke, Komatsuzaki Tamiki
An Information-Theoretical approach to Local Equilibrium State Analysis for Single-Molecule Time-Series 第51回日本生物物理学会年会
(10.28-10.30 ,2013), 国立京都国際会館 京都府京都市 (ポスター) ( 発表日: 2013.10. 30)

[82]Nag Preetom, Teramoto Hiroshi, Li Chun-Biu, Komatsuzaki Tamiki
Coherent dynamics in colloidal fluids in terms of Lagrangian coherent structures (LCS) 第51回日本生物物理学会年会
(10.28-10.30 ,2013), 国立京都国際会館 京都府京都市 (ポスター) ( 発表日: 2013.10. 30)

[81]永幡 裕, 寺本 央, Li Chun-Biu, 小松崎 民樹
一分子時系列から抽出されたマルコフ連鎖 定常ネットワーク における遷移確率が“最小”となる分子の“状態”の同定 第51回日本生物物理学会年会
(10.28-10.30 ,2013), 国立京都国際会館 京都府京都市 (ポスター) ( 発表日: 2013.10. 29)

[80]Sultana Tahmina, Takagi Hiroaki, Morimatsu Miki, Teramoto Hiroshi, Li Chun-Biu, Sako Yasushi, Komatsuzaki Tamiki
A Multiscale Kinetic Scheme Extracted from EGFR-Grb2 Single Molecule Reaction 第51回日本生物物理学会年会
(10.28-10.30 ,2013), 国立京都国際会館 京都府京都市 (ポスター) ( 発表日: 2013.10. 29)

[79]Chun-Biu Li
Inferring Kinetics Objectively from Single Molecule Time Series with Full Information Content 第51回日本生物物理学会年会
(10.28-10.30 ,2013), 国立京都国際会館 京都府京都市 (招待, 口頭) ( 発表日: 2013.10. 28)

[78]永幡 裕, 寺本 央, 堀山 貴史, Chun-Biu Li, 小松崎 民樹
定常マルコフ連鎖から階層構造を抽出する際に生じる組み合わせ爆発 湊離散構造処理系プロジェクト ERATO セミナー
(10.01 ,2013), 北海道大学工学部 北海道札幌市 (口頭) ( 発表日: 2013.10. 01)

[77]永幡 裕, 寺本 央, Chun-Biu Li, 河合 信之輔, 小松崎 民樹
反応の運命を分ける反応性境界: 定義の一般化とH5+プロトン移動反応における反応性境界の抽出 第7回分子科学討論会2013京都
(9.24-9.27 ,2013), 京都テルサ 京都府京都市 (口頭) ( 発表日: 2013.9. 25)

[76]永幡 裕, 寺本 央, 堀山 貴史, Chun-Biu Li, 小松崎 民樹
Identifying the most distinct disjoint sets to extract hierarchical structure in Markov chain steady state network extracted from time series by finding “minimum” transition probability A Symposium on Single Molecule Biophysics and Cyt c Biochemistry
(8.23-8.25 ,2013), 定山渓ビューホテル 北海道札幌市 (口頭) ( 発表日: 2013.8. 25)

[75]Naoki Miyagawa, Hiroshi Teramoto, Chun Biu Li, Tamiki Komatsuzaki
Information of multi-order correlation in pattern formation A Symposium on Single Molecule Biophysics and Cyt c Biochemistry
(8. 23-8. 25 ,2013), 定山渓ビューホテル 札幌市 (口頭) ( 発表日: 2013.8. 25)

[74]Nag Preetom, Hiroshi Teramoto, Chun Biu Li, Tamiki Komatsuzaki
Co-operative motion in colloidal fluids in terms of Lagrangian Coherent Structures(LCS) A Symposium on Single Molecule Biophysics and Cyt c Biochemistry
(8. 23-8. 25 ,2013), 定山渓ビューホテル 札幌市 (口頭) ( 発表日: 2013.8. 25)

[73]永幡 裕, 寺本 央, Chun-Biu Li, 河合 信之輔, 小松崎 民樹
2つの反応方向を持つサドルにおける化学反応:行先・起源を分ける反応性境界の抽出 日本化学会北海道支部2013年夏季研究発表会
( ,2013), 北見工業大学 北海道北見市 (口頭) ( 発表日: 2013.7. 20)

[72]小松崎 民樹, Chun Biu Li, 寺本央, 河合信之輔, James N. Taylor
階層性と多様性を内包する生命動態システムの解析基盤創成 平成24年度アライアンス成果報告会
(4.23 ,2013), 北大学術交流会館 (ポスター) ( 発表日: 2013.4. 23)

[71]永幡 裕, 河合 信之輔, 寺本 央, 李 振風, 小松崎 民樹
反応の「始状態・終状態」を一義的に分ける相空間構造 日本物理学会第68回年次大会
(3. 26-3. 29 ,2013), 広島大学 東広島キャンパス 東広島市 (口頭)

[70]Chun Biu Li, Tamiki Komatsuzaki
Capturing Full Information Contents from Single Molecule Dwell-time Time Series with Minimum Excessive Information 日本物理学会 第68回年次大会
(3. 26-3. 29 ,2013), 広島大学 東広島キャンパス 東広島市 (口頭) ( 発表日: 2013.3. 29)

[69]T. Sultana, H. Takagi, M. Morimatsu, H. Teramoto, C. Li, Y. Sako, T. Komatsuzaki
Multiscale Hidden Markovian Network Buried in Recognition Reaction of EGFR and Grb2. 2012年度 日本生物物理学会北海道支部例会
( ,2013), 北海道大学理学部 札幌市 (口頭) ( 発表日: 2013.3. 5)

[68]千葉勇太, 河合信之輔, 馬場昭典, 寺本央, 李振風, 小松崎民樹
一分子時系列から掘り起こす多次元自由エネルギー地形の情報理論的構成法の開発 化学系学協会北海道支部冬期研究発表会
(1.30 ,2013), 北海道大学 (口頭) ( 発表日: 2013.1. 30)

[67]永幡裕, 寺本央, Chun Biu Li, 河合信之輔, 小松崎民樹
2つの反応方向を持つサドルにおける化学反応:反応の運命を分ける反応性境界の抽出 化学系学協会北海道支部2013年冬季研究発表会
(1.29-1.30 ,2013) 札幌 (口頭) ( 発表日: 2013.1. 30)

2012

[66]千葉勇太, 河合信之輔, 馬場昭典, 寺本央, 李振風, 小松崎民樹
一分子時系列から掘り起こす多次元自由エネルギー地形の情報理論的構成法の開発 定量生物学会
(1.8-1.9 ,2012), 名古屋大学 (ポスター)

[65]Chun Biu Li
Multiparameter Single Molecule Fluorescence Analysis of an a- Chymotrypsin Catalyzed Reaction 第1回 少数性生物学領域会議
(2.19 ,2012) ニセコ (口頭) ( 発表日: 2012.2. 19)

[64]Tahmina Sultana, Hiroshi Teramoto, Chun Biu Li, Tamiki Komatsuzaki
Extracting the Reaction Network Buried in Single Molecule Time Series of Epidermal Growth Factor Receptor (EGFR) and Growth Factor Receptor-Bound Protein 2 (Grb2) in Cytoplasm IGP International Symposium 2012
(3.2 ,2012), Hokkaido University (口頭) ( 発表日: 2012.3. 2)

[63]Chun-Biu Li
An information theoretic approach to dynamical irreversibility from time series DYNAMICS OF COMPLEX SYSTEMS 2012
(3.8 ,2012), 北海道大学 札幌市 (招待, 口頭) ( 発表日: 2012.3. 8)

[62]Chun-Biu Li
Dynamic Disorder in Single Enzyme Experiments: Facts and Artifacts 水和とATPサテライトミーティング「蛋白質折り畳みの理解に向けた一分子基礎科学を目指して」
(3.10-3.12 ,2012) 仙台作並 (招待, 口頭)

[61]永幡裕, 河合信之輔, 寺本央, 李振風, 小松崎民樹
2つの反応方向をもつ鞍点での、反応の「過去・未来」を一義的に分ける相空間構造 日本物理学会第67回年次大会
(3.24 ,2012), 関西学院大学西宮上ケ原キャンパス (口頭) ( 発表日: 2012.3. 24)

[60]菊地正浩, 河合信之輔, 寺本央, Chun Biu Li, 小松崎民樹
非リボソームペプチド合成酵素の多次元挙動解析理論の開発 日本物理学会第67回年次大会
(3.27 ,2012), 関西学院大学西宮上ケ原キャンパス (ポスター) ( 発表日: 2012.3. 27)

[59]千葉勇太, 河合信之輔, 馬場昭典, 寺本央, Chun Biu Li, 小松崎民樹
一分子時系列から“掘り起こす”多次元自由エネルギー地形の情報理論的構成法の開発 日本物理学会第67回年次大会
(3.27 ,2012), 関西学院大学西宮上ケ原キャンパス (ポスター) ( 発表日: 2012.3. 27)

[58]宮川尚紀, 寺本央, 李振風, 小松崎民樹
大域的パターンの連結情報量とその分解可能性 日本物理学会第67回年次大会
(3.27 ,2012), 関西学院大学西宮上ケ原キャンパス (口頭) ( 発表日: 2012.3. 27)

[57]Chun-Biu Li
Data-Driven Modeling of the Complex Kinetics and Dynamics from Single Protein Motor Rotation Experiments Quantitative Developmental Biology
(3.26 ,2012), RIKEN Center for Developmental Biology (CDB) (ポスター) ( 発表日: 2012.3. 26)

[56]宮川尚紀, 寺本央, 李振風, 小松崎民樹
大域的パターンの連結情報量とその分解可能性 日本物理学会第67回年次大会
(3.27 ,2012), 関西学院大学西宮上ケ原キャンパス 兵庫県 (口頭) ( 発表日: 2012.3. 27)

[55]永幡裕, 寺本央, 李 振風, 河合信之輔, 小松崎民樹
Extracting Boundary of Reaction Associated with an Index-two-saddle from a Two Degree-of-Freedom System 28th Symposium on Chemical Kinetics and Dynamics
(6.6 ,2012), Kyushu University Chikushi campus 福岡市 (口頭) ( 発表日: 2012.6. 6)

[54]Preetom Nag, Hiroshi Teramoto, Chun Biu Li, Tamiki Komatsuzaki
Extracting quasi-normally repelling material surface by re-formulating variational Lagrangian coherent structure(LCS) theory 日本物理学会秋季大会
(9.18-9.21 ,2012), 横浜国立大学 (口頭) ( 発表日: 2012.9. 18)

[53]Chun Biu Li, 小松崎民樹
複雑分子系を読み解くための新しい1分子理論 第6回分子科学討論会
(9.18-9.21 ,2012) (口頭) ( 発表日: 2012.9. 21)

[52]永幡 裕, 河合 信之輔, 寺本 央, Chun-Biu Li, 小松崎 民樹
高次ランクサドルを含めた化学反応ダイナミクスにおける反応の境界 第6回分子科学討論会
(9.18-9.21 ,2012) (ポスター) ( 発表日: 2012.9. 19)

[51]Chun Biu Li
How to uncover hidden statistical features from noisy single molecule time series? G3 meeting Japanese Nano-Macro materials, Devices and System Research Alliance
(10.11-10.12 ,2012), Campus Innovation Center, Tokyo Institute of Technology TOKYO (招待, 口頭) ( 発表日: 2012.10. 12)

2011

[50]Z. Liu, H. Teramoto, C. Li, T. Komatsuzaki
Extracting Protein Dynamics from Single Molecular Time Series Fusion Bioscience International Symposium
(3.4 ,2011), Hokkaido University (ポスター) ( 発表日: 2011.3. 4)

[49]C. Li
The Hidden Markov Modeling with Exact Information Content of Dwell-Time Time Series Dynamics of complex systems  2011 ― 時間発展の非可逆性と予測可能性の限界に関する諸分野からの提言 ―
(3.7 ,2011), 北海道大学 札幌市 (招待, 口頭) ( 発表日: 2011.3. 7)

[48]伊藤 正寛, 馬場 昭典, 李 振風, 小松崎 民樹
詳細つり合いが成立しない遷移ネットワークから構成される有効エネルギー地形 2010年度 日本生物物理学会北海道支部例会
(3.8 ,2011), 北海道大学理学部 (口頭) ( 発表日: 2011.3. 8)

[47]宮川 尚紀, 寺本 央, 李 振風, 小松崎 民樹
多変数確率過程の大域的パターンと高次相関情報量(Connected Information) 日本物理学会 第66回年次大会
(3 ,2011), 新潟大学五十嵐キャンパス (口頭) ( 発表日: 2011.3)

[46]永幡 裕, 河合 信之輔, 寺本 央, 李 振風, 小松崎 民樹
ランク2サドルとその近傍に於ける遷移ダイナミクス 日本物理学会 第66回年次大会
(3 ,2011), 新潟大学五十嵐キャンパス (口頭) ( 発表日: 2011.3)

[45]伊藤 正寛, 馬場 昭典, 李 振風, 小松崎 民樹
詳細つり合いが成立しない遷移ネットワークから構成される有効エネルギー地形 日本物理学会 第66回年次大会
(3 ,2011), 新潟大学五十嵐キャンパス (口頭) ( 発表日: 2011.3)

[44]李 振風, 小松崎 民樹
Learning the Kinetic Scheme with Minimum Excessive Information from Dwell-Time Time Series 日本生物物理学会 2011
(9.17 ,2011), 東北大学 仙台市 ( 発表日: 2011.9. 17)

[43]宮川 尚紀, 寺本 央, 李 振風, 小松崎 民樹
Mathematical Principles of Hierarchical Structures in Multivariate Stochastic Process 日本生物物理学会 2011
(9.17 ,2011), 東北大学 仙台市 (口頭) ( 発表日: 2011.9. 17)

[42]永幡 裕, 河合 信之輔, 寺本 央, 李 振風, 小松崎 民樹
二つの反応方向をもつ鞍点における反応の決定性 分子科学討論会(札幌)2011
(9.21 ,2011), 札幌コンベンションセンター 札幌市 (口頭) ( 発表日: 2011.9. 21)

[41]宮川 尚紀, 寺本 央, 李 振風, 小松崎 民樹
階層構造をつくる多変数確率過程の数理 分子科学討論会(札幌)2011
(9.21 ,2011), 札幌コンベンションセンター 札幌市 (ポスター) ( 発表日: 2011.9. 21)

[40]Sultana Tahmina, Komatsuzaki Tamiki, Li Chun Biu, Teramoto Hiroshi
Extracting the reaction network buried in single Molecule Time Series of Epidermal Growth Factor Receptor and Grb2 分子科学討論会(札幌)2011
(9.22 ,2011), 札幌コンベンションセンター 札幌市 (ポスター) ( 発表日: 2011.9. 22)

2010

[39]C. Li
Transition to Chaos above the Reaction Threshold: Bifurcations, Resonances and Future Challenges Workshop on dynamical systems theory and reaction dynamics toward large systems
(1 ,2010) Kyoto (招待、口頭) ( 発表日: 2010.1)

[38]桜井 大督, 李 振風, 小松崎 民樹
粘菌の作るネットワークの時間発展 定量生物学の会
(1 ,2010), 大阪大学銀杏会館 吹田市 (一般、ポスター) ( 発表日: 2010.1)

[37]伊藤 正寛, 馬場 昭典, 李 振風, 小松崎 民樹
複雑ネットワークから階層的なツリー構造(disconnectivity graph)を構成する方法論に関する一考察 日本生物物理学会 2009年度北海道支部例会
(3 ,2010), 北海道大学理学部 (一般, 口頭) ( 発表日: 2010.3)

[36]伊藤 正寛, 馬場 昭典, 李 振風, 小松崎 民樹
複雑ネットワークから階層的なツリー構造(disconnectivity graph)を構成する方法論に関する一考察 日本物理学会 第65回年次大会
(3 ,2010), 岡山大学津島キャンパス (一般, 口頭) ( 発表日: 2010.3)

[35]宮川 尚紀, 李 振風, 小松崎 民樹
多変数確率過程の背後に存在する集団運動の数理 日本物理学会第65回年次大会
(3 ,2010), 岡山大学津島キャンパス 岡山市 (一般, ポスター) ( 発表日: 2010.3)

[34]桜井 大督, 李 振風, 寺本 央, 小松崎 民樹
粘菌の自己組織化的な環境適応モデルのダイナミクス 日本物理学会第65回年次大会
(3 ,2010), 岡山大学津島キャンパス 岡山市 (一般, ポスター) ( 発表日: 2010.3)

[33]永幡 裕, 寺本央, 李 振風, 小松崎民樹
可積分系でのエルゴード性を仮定しない反応速度定数の導出 日本物理学会第65回年次大会
(3 ,2010), 岡山大学津島キャンパス 岡山市 (一般, ポスター) ( 発表日: 2010.3)

[32]永幡 裕, 河合 信之輔, 寺本 央, 李 振風, 小松崎 民樹
ランク2サドルにおける遷移ダイナミックスの集団挙動とカオス 第13回理論化学討論会
(5.23-5.25 ,2010), 北海道大学 (一般, ポスター) ( 発表日: 2010.5. 24)

[31]伊藤 正寛, 馬場 昭典, 李 振風, 小松崎 民樹
自由エネルギー地形概念の再考 第13回理論化学討論会
(5 ,2010), 北海道大学 学術交流会館 札幌市 (ポスター) ( 発表日: 2010.5)

[30]C.B. Li
Time-dependent Perturbation Analysis of Small Nonintegrable Hamiltonian System Dynamics of Complex Systems Seminar
(6.9 ,2010), Department of Mathematics, Hokkaido Univ. Japan (invited talk) ( 発表日: 2010.6. 9)

[29]伊藤 正寛, 馬場 昭典, 李 振風, 小松崎 民樹
蛋白質beta3sの自由エネルギー地形-自由エネルギー地形概念の再考- 第10回日本蛋白質科学会年会
(6 ,2010), 札幌コンベンションセンター 札幌市 (ポスター) ( 発表日: 2010.6)

[28]小松崎民樹, Chun Biu Li, 寺本央, 馬場昭典, 河合信之輔
階層性、適応性、因果性を内包する生命システムの動態解析基盤 アライアンス「医療材料・デバイス」G3グループ キックオフミーティング
(7.16-7.17 ,2010) 札幌 (招待, 口頭) ( 発表日: 2010.7. 17)

[27]C. Li, T. Komatsuzaki
When one plus one is more than two:Theoretical challenges in learning from the next generation single- and multiple- molecule experiments 生物物理学会第48回年会
(9 ,2010), 東北大学川内キャンパス 仙台市 (招待, 口頭) ( 発表日: 2010.9)

[26]李 振風, 小松崎 民樹
一分子時系列情報に基づく革新的モデリング 第36回生体エネルギー研究会/特定領域「革新的ナノバイオ」合同シンポジウム
(11 ,2010), 大阪大学銀杏会館 吹田市 (ポスター) ( 発表日: 2010.11)

2009

[25]李 振風, 小松崎 民樹
Innovative Multiscale Modeling of Biological Systems on the Single Molecule Level 特定領域研究「膜超分子モーターの革新的ナノサイエンス」班会議
(6.17-6.19 ,2009), 万国津梁館 沖縄 (ポスター)

[24]Chun Biu Li
What is the Relevant Information in Modeling the Dynamics of Complex Systems from Measurements? Dynamics of complex systems 2009 -複雑系解析における未解決問題への新しい挑戦 -
(8.31-9.2 ,2009), 北海道大学 札幌市 (招待, 口頭) ( 発表日: 2009.8. 31)

[23]李 振風
Quantifying the Local Transition Heterogeneity of Multiscale Complex Networks Reconstructed from Single-Molecule Time Series 第47回日本生物物理学会年会
(10.30-11.1 ,2009), アスティとくしま (ポスター)

2008

[22]Chun Biu Li, Haw Yang, 小松崎 民樹
Multiscale Complex network of protein conformation fluctuations in single molecule time series 日本生物物理学会北海道支部例会
(3.18 ,2008), 北海道大学 (口頭) ( 発表日: 2008.3. 18)

[21]河合信之輔, Chun Biu Li, 小松崎 民樹, 山下雄史, 藤村陽, 戸田幹人
反応O(1D)+N2O →NO+NOの相空間構造の解析 化学反応討論会
(6.2-6.4 ,2008), 北海道大学 (ポスター)

[20]Chun Biu Li, M. Toda, Tamiki Komatsuzaki
Uncovering the Phase Space Geometry of Reaction Dynamics 化学反応討論会
(6.2-6.4 ,2008), 北海道大学 (口頭)

[19]Chun Biu Li
An Information-theoretic Approach to unveil the Multiscale Dynamics of Biophysical Systems: Information Flows among Different Scales Dynamics of complex systems 2008 -- 数学的予測方式の可能性と諸分野からのニーズ --
(9.1-9.3 ,2008), 北海道大学 (招待, 口頭)

[18]Chun Biu Li
Understanding the Multiscale Dynamics of Complex Biological Systems from Single Molecule Experiments 日本生物物理学会シンポジウム「レア・イベントから創薬へ(岐阜大学桑田一夫氏、東京大学分子細胞生物学研究所北尾彰朗氏主催)」
(12.3-12.5 ,2008) 福岡 (招待, 口頭)

[17]清一人, 馬場昭典, Chun Biu Li, 小松崎民樹
1分子計測から読み解く状態遷移ネットワーク-機械受容チャネルを例に 日本生物物理学会シンポジウム「イオンチャネルゲーティングのダイナミクスをイメージする(老木成稔氏(福井大学)、曽我部正博氏 (名古屋大学)主催 )」
(12.3-12.5 ,2008) 福岡 (招待, 口頭)

[16]清一人, 馬場昭典, Chun Biu Li, 小松崎民樹
機械受容イオンチャネルの統計的解析―ゲーティング機構の解明に向けて― 日本生物物理学会
(12.3-12.5 ,2008) 福岡 (ポスター)

2007

[15]Chun Biu Li
Uncovering the Phase Space Geometry of Reaction Dynamics: Theory and Practice 首都大学東京・非線形物理研究室セミナー
(2.6-2.7 ,2007), 首都大学東京 (招待, 口頭)

[14]松永康佑, Chun Biu Li, 小松崎 民樹
タンパク質の階層的ダイナミックスにおける多様な時空間スケールでの協同現象 第61回日本物理学会
(3.18-3.21 ,2007) 鹿児島 (口頭)

[13]Li Chun Biu, Tamiki Komatsuzaki
Novel method and theory of multi-time-scale dynamical state-network from time series of single molecule experiments 日本物理学会 第62回年次大会
(9.21-9.24 ,2007) (ポスター)

[12]Li Chun Biu
Mining dynamical information for large-scale protein MD simulation: A geometrical perspective High-performance Molecular Simulation Team
(11.22 ,2007), RIKEN Yokohama (招待, 口頭) ( 発表日: 2007.11. 22)

[11]Chun Biu Li, Haw Yang, 小松崎 民樹
Complex Multiscale Networks and Information Flows for Protein Dynamics from Single-molecule Time Series 第45回日本生物物理学会
(12.21-12.23 ,2007) 横浜 (口頭)

2006

[10]Chun Biu Li, 馬場 昭典, 小松崎 民樹
1分子時系列情報から構成される状態空間構造:反応遷移ネットワーク構造 第61回日本物理学会
(3.26-3.30 ,2006) 愛媛 (口頭)

[9]小路口暁, Chun Biu Li, 小松崎 民樹, 戸田幹人
HCNの異性化反応の非エルゴード性 第61回日本物理学会
(3.26-3.30 ,2006) 愛媛 (口頭)

[8]小路口暁, Chun Biu Li, 小松崎 民樹, 戸田幹人
分子異性化反応のモデルにおける異常拡散 「強レーザー光子場における分子制御」成果報告会
(9.14-9.16 ,2006) 東京 (ポスター)

[7]Chun Biu Li
Extracting Conformational Dynamics on a Photon by Photon basis in Single Molecule Electron Transfer 大阪大学蛋白質研究所セミナー 「蛋白質の機能運動と折り畳み運動」
(9.28-9.29 ,2006), 大阪大学 (招待, 口頭)

2005

[6]Chun Biu Li, 松永康佑, 戸田幹人, 小松崎民樹
Geometrical Structure buried in the phase space of Stochastic Structural Transition: Perspectives from Time Series Analysis 「複雑な多谷ポテンシャルエネルギー面上で生起する動力学諸問題:蛋白質とその周辺」研究会
(3.14-3.16 ,2005), 神戸大 (口頭)

[5]Chun Biu Li, 松永康佑, 戸田幹人, 小松崎民樹
Dynamical Reaction Conduit in Chaotic Multi-dimensional Phase Space: Molecular Motions and the Origin of Stochastic Transitions 第9回理論化学討論会
(5.17-5.19 ,2005) 京都 (口頭)

[4]小松崎民樹, Chun Biu Li
化学反応はなぜ生起するのか?:遷移状態概念再考 第128回自然環境論セミナー
(7.5 ,2005), 神戸大学発達科学部 (招待, 口頭) ( 発表日: 2005.7. 5)

[3]Chun Biu Li, 小松崎民樹
Dynamical Reaction Conduit in Chaotic Multi-dimensional Phase Space: Molecular Motions and the Origin of Stochastic Transitions 第9回日本物理学会秋期年会
(9.19-9.22 ,2005), 同志社 (口頭)

[2]Chun Biu Li, 小松崎 民樹
多次元エネルギー地形の状態空間構造に基づく生体分子系の構造転移ダイナミクスの原理的理解(Understanding of the Origin of Transitions in Biological Molecules from the State Space Structures on Multi-dimensional Energy Landscapes) 第9回日本生物物理学会
(11.23-11.25 ,2005) 札幌 (ポスター)

[1]松永康佑, Chun Biu Li, 小松崎 民樹
タンパク質系の協調的運動に対するカオス時系列解析 (Chaotic time series analysis of collective motions in proteins) 第9回日本生物物理学会
(11.23-11.25 ,2005) 札幌 (ポスター)

国際発表

2016

[83]Yuji Tamiya, Chun-Biu Li, Rikiya Watanabe, Hiroyuki Noji, Tamiki Komatsuzaki
The Non-equilibrium Effects on Reaction Kinetics of F1-ATPase
The 17th RIES-Hokudai International Symposium(12.13-12.14 ,2016), Chateraise Gateaux Kingdom Sapporo, Sapporo, Hokkaido 12, 13 (Poster)

[82]J.N. Taylor, Chun-Biu Li, Katsumasa Fujita, Tamiki Komatsuzaki
Data-Driven Approaches to Raman Microscopic Image Analysis
The 17th RIES-Hokudai International Symposium(12.13-12.14 ,2016), Chateraise Gateaux Kingdom Sapporo, Sapporo, Hokkaido 12, 13 (Poster)

[81]Preetom Nag, Khalifa Mohammad Helal, Hiroshi Teramoto, Chun-Biu Li, Hisashi Haga, Tamiki Komatsuzaki
Dynamical Heterogeneity During Collective Migration of MDCK Epithelial Monolayer
The 17th RIES-Hokudai International Symposium(12.13-12.14 ,2016), Chateraise Gateaux Kingdom Sapporo, Sapporo, Hokkaido 12, 13 (Poster)

[80]Khalifa Mohammad Helal, Preetom Nag, Hiroshi Teramoto, Chun Biu Li, Hisashi Haga, Tamiki Komatsuzak
Collective Cell Migration: Underlying Dynamics and Emergent Structures of Heterogeneity
The 17th RIES-Hokudai International Symposium(12.13-12.14 ,2016), Chateraise Gateaux Kingdom Sapporo, Sapporo, Hokkaido 12, 13 (Poster)

[79]Chun-Biu Li
A Nano-Scale Key-and-Unlock Mechanism in the F1-ATPase revealed by Single Molecule Time Series Analysis
Seminar at Beijing Computational Science Research Center(5.20 ,2016), Beijing Computational Science Research Center, Beijing, China 5, 20 (invited, oral)

[78]Chun Biu Li
From single molecule time series to networks and dynamics: approaches from information theory
Conference on the Time in Biological Systems and Beyond(3.28-3.29 ,2016), National Tsing Hua University, Hsinchu, Taiwan 3, 29 (invited, oral)

[77]J. Nick Taylor, Almar F. Palonpon, Chun Biu Li, Katsumasa Fujita, Tamiki Komatsuzaki
Data-driven quantification of heterogeneous microenvironments in live-cell Raman microscopic images
The Biophysical Society 2016 BPS Annual Meeting(2.27-3.2 ,2016), Los Angeles Convention Center, Los Angeles, USA 2, 27 (oral)

[76]Chun Biu Li
Time Series, Networks and Dynamics: Constructing Hidden Markov Model from Information Theory
Department Seminar in Department of Chemistry, Computational Biophysical Chemistry(2.22 ,2016), Hong Kong University, Hong Kong, China 2, 22 (invited, oral)

2015

[75]Nick Taylor, Almar F. Palonpon, Chun Biu Li, Katsumasa Fujita, Tamiki Komatsuzaki
Data-driven quantification of heterogeneous microenvironments in live-cell Raman microscopic images
Symposium #121 Deciphering molecular complexity from protein functions to cellular network (The 2015 International Chemical Congress of Pacific Basin Societies)(12.15-12.16 ,2015), Convention Center, Hawaii, USA 12, 16 (oral)

[74]Yutaka Nagahata, Satoshi Maeda, Hiroshi Teramoto, Chun-Biu Li, Tetsuya Taketsugu, Tamiki Komatsuzaki
Developing high precision algorithm to predict observation timescale hierarchy of an isomerization reaction network
The 16th RIES-Hokudai International Symposium(11.10-11.11 ,2015), Chateraise Gateaux Kingdom Sapporo, Sapporo, Japan 11, 10 (Poster)

[73]Genming Wang, Chun-Biu Li, Hitoshi Tatsumi, Tamiki Komatsuzaki
Kinetics of Multiple conductance levels of Mechanosensitive Ion Channel
The 16th RIES-Hokudai International Symposium(11.10-11.11 ,2015), Chateraise Gateaux Kingdom Sapporo, Sapporo, Japan 11, 10 (Poster)

[72]Yuji Tamiya, Chun-Biu Li, Rikiya Watanabe, Hiroyuki Noji, Tamiki Komatsuzaki
The Onset of Non-equilibrium Effects at High Temperature in the Reaction Kinetics of F1-ATPase
The 16th RIES-Hokudai International Symposium(11.10-11.11 ,2015), Chateraise Gateaux Kingdom Sapporo, Sapporo, Japan 11, 10 (Poster)

[71]Chun-Biu Li
The Key and Unlock Mechanisms in F1-ATPase Unveiled by Single Molecule Time Series Analysis
The 4th Workshop on Molecular & Chemical Kinetics(9.7-9.9 ,2015), Berlin, Germany (invited talk)

[70]Chun-Biu Li
Searching for New Mathematical Frameworks to Understand Complex Systems in the Real World
Cross-border Forum of “Money problems, Job market, and Chaos: mathematical and economical perspective on distribution of value from a viewpoint of Italy’s and Japan’s Economy(7.29 ,2015), Hokkaido Univ., Sapporo, Japan 7, 29 (invited talk)

[69]Nick Taylor, Chun Biu Li, David R. Cooper, Christy F. Landes, Tamiki Komatsuzaki
Error-based Extraction of States and Energy Landscapes from Experimental Single-Molecule Time-Series
The Complexity of Dynamics Kinetics from Single Molecules to Cells(6.14-6.18 ,2015), Telluride Elementary School, Telluride, CO, U.S. 6, 18 (Oral)

[68]Chun-Biu Li
The Roles of ATP Hydrolysis Revealed by Single Molecule Time Series Analysis of Rotary Fluctuations in F1-ATPase
The Complexity of Dynamics Kinetics from Single Molecules to Cells(6.14-6.18 ,2015), Telluride Elementary School, Telluride, CO, U.S. 6, 14 (invited,oral)

[67]Yutaka Nagahata, Satoshi Maeda, Hiroshi Teramoto, Chun-Biu Li, Takashi Horiyama, Tetsuya Taketsugu, Tamiki Komatsuzaki
Deciphering timescale hierarchy encoded in complex reaction networks
31st Symposium on Chemical Kinetics and Dynamics(6.3-6.5 ,2015), Frontier Research in Applied Sciences Bldg., Faculty of Engineering, Hokkaido University, Sapporo, Hokkaido 6, 3 (poster)

[66]Chun-Biu Li
Robust Construction of Dwell-Time Statistics from Experimental and Simulation Time Series
Department seminar(4.17 ,2015), Max Planck Institute of Colloids and Interfaces, Potsdam, Germany 4, 17 (invited talk)

[65]Chun-Biu Li
Time Series, Networks and Dynamics: Constructing Hidden Markov Model from Information Theory
Department seminar(4.14 ,2015), Department of Mathematics, Computer Science and Bioinformatics, Free University of Berlin, Germany 4, 14 (invited talk)

[64]Yutaka Nagahata, Hiroshi Teramoto, Takashi Horiyama, Chun-Biu Li, Tamiki Komatsuzaki
Timescale hierarchies of complex reaction network
Workshop on dynamical systems and computation 2015‎(3.3-3.6 ,2015), Hokkaido University, Sapporo, Hokkaido 3, 4 (oral)

[63]Chun Biu Li
Single Molecule Time Series Analysis of F1-ATPase to Unravel the Role of ATP Hydrolysis and Thermal Fluctuations
Seminar at Max Planck Institute of Colloids and Interfaces(1.7 ,2015), Max Planck Institute of Colloids and Interfaces, Potsdam, Germany 1, 7 (invited, oral)

[62]Bo Shuang, David Cooper, J. Nick Taylor, Lydia Kisley, Jixin Chen, Wenxiao Wang, Chun Biu Li, Tamiki Komatsuzaki, Chrisy Landes
Fast Step Transition and State Identification (STaSI) for Discrete Single-Molecule Data Analysis
The 2015 Quantitative BioImaging Conference(1.7-1.9 ,2015), Institut Pasteur, Paris, France (poster)

2014

[61]Satoru Tsugawa, Chun-Biu Li, Tamiki Komatsuzaki
An extraction method of local microtubule alignments in Arabidopsis sepal
The 15th Ries-Hokudai International Symposium 響[hibiki](12.16-12.17 ,2014), CHÂTERAISÉ Gateaux Kingdom SAPPORO, Sapporo, Hokkaido 12, 16 (poster)

[60]J.N. Taylor, Chun Biu Li, David R. Cooper, Christy F. Landes, Tamiki Komatsuzaki
Error-based Extraction of Effective Free Energy Landscapes from Experimental Single-Molecule Time-Series
The 15th Ries-Hokudai International Symposium 響[hibiki](12.16-12.17 ,2014), CHÂTERAISÉ Gateaux Kingdom SAPPORO, Sapporo, Hokkaido 12, 16 (poster)

[59]Yuji Tamiya, Chun-Biu Li, Rikiya Watanabe, Hiroyuki Noji, Tamiki Komatsuzaki
Temperature Dependency of Molecular Motor
The 15th Ries-Hokudai International Symposium 響[hibiki](12.16-12.17 ,2014), CHÂTERAISÉ Gateaux Kingdom SAPPORO, Sapporo, Hokkaido 12, 16 (poster)

[58]Yutaka Nagahata, Satoshi Maeda, Hiroshi Teramoto, Chun-Biu Li, Takashi Horiyama, Tetsuya Taketsugu, Tamiki Komatsuzaki
An extraction of embedded timescale hierarchies buried in complex reaction network
The 15th Ries-Hokudai International Symposium 響[hibiki](12.16-12.17 ,2014), CHÂTERAISÉ Gateaux Kingdom SAPPORO, Sapporo, Hokkaido 12, 16 (poster)

[57]Preetom Nag, Hiroshi Teramoto, Chun Biu Li, Joseph Z. Terdik, Norbert F. Scherer, Tamiki Komatsuzaki
Local-heterogeneous responses and transient dynamics in colloidal fluids
The 15th Ries-Hokudai International Symposium 響[hibiki](12.16-12.17 ,2014), CHÂTERAISÉ Gateaux Kingdom SAPPORO, Sapporo, Hokkaido 12, 16 (poster)

[56]Yuji Tamiya, Chun-Biu Li, Rikiya Watanabe, Hiroyuki Noji, Tamiki Komatsuzaki
Data Driven Approach to Dynamics of Protein Motor
New Challenges in Complex Systems Science(10.24-10.26 ,2014), Nishiwaseda Campus, Waseda University, Tokyo, Japan 10, 25 (poster)

[55]Chun Biu Li
Challenges in Understanding Complex Systems at the Single Molecule Level
New Challenges in Complex Systems Science(10.24-10.26 ,2014), Nishiwaseda Campus, Waseda University, Tokyo, Japan 10, 25 (invited, oral)

2013

[54]Chun Biu Li
Time Series, Networks and Dynamics: A Perspective from the Information Theory
The 14th RIES-HOKUDAI International Symposium 網[mou](12. 11-12. 12 ,2013), CHÂTERAISÉ Gateaux Kingdom SAPPORO, Sapporo, Japan 12, 11 (invited, oral)

[53]J. N. Taylor, Chun Biu Li, Shinnosuke Kawai, Tamiki Komatsuzaki
An Information-Theoretical Approach to Local Equilibrium State Analysis for Single-Molecule Time-Series
The 14th RIES-HOKUDAI International Symposium 網[mou](12. 11-12. 12 ,2013), CHÂTERAISÉ Gateaux Kingdom SAPPORO, Sapporo, Japan 12, 11 (poster)

[52]Tahmina Sultana, Hiroaki Takagi, Miki Morimatsu, Hiroshi Teramoto, Chun Biu Li, Yasushi Sako, Tamiki Komatsuzaki
Scrutiny of Heterogeneity in Memory by Extracting Reaction Network Buried in Single Molecule Time Series of EGFR and Grb2
The 14th RIES-HOKUDAI International Symposium 網[mou](12. 11-12. 12 ,2013), CHÂTERAISÉ Gateaux Kingdom SAPPORO, Sapporo, Japan 12, 11 (poster)

[51]Yutaka Nagahata, Hiroshi Teramoto, Takashi Horiyama, Chun Biu Li, Tamiki Komatsuzaki
Toward understanding hierarchical structure of complex reaction networks extracted from single molecule time series
The 14th RIES-HOKUDAI International Symposium 網[mou](12. 11-12. 12 ,2013), CHÂTERAISÉ Gateaux Kingdom SAPPORO, Sapporo, Japan 12, 11 (poster)

[50]Preetom Nag, Hiroshi Teramoto, Chun Biu Li, Tamiki Komatsuzaki
Coherent dynamics in colloidal fluids in terms of Lagrangian Coherent Structures (LCSs)
The 14th RIES-HOKUDAI International Symposium 網[mou](12. 11-12. 12 ,2013), CHÂTERAISÉ Gateaux Kingdom SAPPORO, Sapporo, Japan 12, 11 (poster)

[49]Naoki Miyagawa, Hiroshi Teramoto, Chun Biu Li, Tamiki Komatsuzaki
Information of multi-order correlation in pattern formation
The 14th RIES-HOKUDAI International Symposium 網[mou](12. 11-12. 12 ,2013), CHÂTERAISÉ Gateaux Kingdom SAPPORO, Sapporo, Japan 12, 11 (poster)

[48]Kunihiko Ibe, Hiroshi Teramoto, Chun Biu Li, Tamiki Komatsuzaki
Extracting the Protein-folding Dynamics from Single Molecule Time Series
The 14th RIES-HOKUDAI International Symposium 網[mou](12. 11-12. 12 ,2013), CHÂTERAISÉ Gateaux Kingdom SAPPORO, Sapporo, Japan 12, 11 (poster)

[47]Chun-Biu Li, Tamiki Komatsuzaki
Toward the Decoding of Single Nucleotides Tunneling Current by Change Point Analysis
G3meeting,Academia Sinica(10.21-10.22 ,2013) (Poster)

[46]James N. Taylor, Shinnosuke Kawai, Chun Biu Li, Tamiki Komatsuzaki
Let Systems Tell for themselves: Energy Landscape and Complex Network
G3meeting,Academia Sinica(10.21-10.23 ,2013), Taipei, Taiwan

[45]Chun-Biu Li
When Computational Mechanics Meets Single Molecule Time Series
2013 International Symposium on Nonlinear Theory and its Applications(9.8-9.11 ,2013), Santa Fe Community Convention Center, Santa Fe , US (invited, Oral)

[44]Yutaka Nagahata, Hiroshi Teramoto, Chun-Biu Li, Tamiki Komatsuzaki
Identifying states in Markov chain steady state network extracted from time series by finding minimum transition probability
The Complexity of Dynamics and Kinetics in Many Dimensions(6.18 ,2013), Telluride Intermediate School, Telluride, CO., US (Oral)

[43]Chun-Biu Li
Does Dynamic Disorder Exist in the Enzymatic Reactions on the Single Molecule Level?
The Complexity of Dynamics and Kinetics in Many Dimensions(6.16-6.17 ,2013), Telluride Intermediate School, Telluride, CO., US (Oral)

[42]Yutaka Nagahata, Hiroshi Teramoto, Chun-Biu Li, Shinnosuke Kawai, Tamiki Komatsuzaki
Reactivity Boundaries to Separate the Fate of a Chemical Reaction Associated with Multiple Saddles
Geometry of Chemical Reaction Dynamics in Gas and Condensed Phases ,Telluride Intermediate School(6.13 ,2013), Telluride, CO., US (Oral)

[41]Chun Biu Li, Tamiki Komatsuzaki
Toward deciphering molecular individuality in systems biology
Gordon Conference on Stochastic Physics in Biology: Foundations and Current Trends(1.13-1.18 ,2013), Ventura, CA, US (Poster)

2012

[40]Tahmina Sultana, Hiroshi Teramoto, Chun Biu Li, Tamiki Komatsuzaki
Extracting the Reaction Network Buried in Single Molecule Time Series of Epidermal Growth Factor Receptor (EGFR) and Growth Factor Receptor-Bound Protein 2 (Grb2) in Cytoplasm
IGP International Symposium 2012(3.2 ,2012), Hokkaido University (oral)

[39]Chun-Biu Li
An information theoretic approach to dynamical irreversibility from time series
Dynamics of complex systems(3.7 ,2012), Hokkaido University (invited)

[38]Chun-Biu Li
Data-Driven Modeling of the Complex Kinetics and Dynamics from Single Protein Motor Rotation Experiments
Quantitative Developmental Biology(3.26 ,2012), RIKEN Center for Developmental Biology (CDB) (poster)

[37]Preetom Nag, Hiroshi Teramoto, Chun Biu Li, Tamiki Komatsuzaki
Extracting quasi-normally repelling material surface by re-formulating variational Lagrangian coherent structure(LCS) theory
The 13th RIES-Hokudai International Symposium (12.13-12.14 ,2012), Chateraise Gateaux Kingdom, Sapporo, Japan (poster)

2011

[36]CB Li
Either contruction of KS from dwell-time time series, or modeling of QD blinking
Telluride Workshop on Complexity of Kinetics and Dynamics in Many Dimension(6.20-6.24 ,2011) (invited)

[35]CB Li
Multiscale Time Series Analysis of Supermolecular Motor Proteins on the Single Molecule Level
Telluride Workshop on Single Molecule Dynamics(6.27-7.1 ,2011) (invited)

[34]Naoki Miyagawa, Hiroshi Teramoto, Chun Biu Li, Tamiki Komatsuzaki
Spatial Heterogeneity of Multivariate Dependence
International Conference of Numerical Analysis and Applied Mathematics(9.19-9.25 ,2011), Greece (invited)

[33]Tahmina Sultana, Hiroshi Teramoto, Chun Biu Li, Tamiki Komatsuzaki
Extracting the reaction network buried in Single Molecule Time Series of Epidermal Growth Factor Receptor and Growth Factor Receptor-Bound Protein 2
12th RIES-Hokudai International Symposium (11.21-11.22 ,2011), Chateraise Gateaux Kingdom Sapporo (poster)

[32], Chun Biu Li, Tamiki Komatsuzaki
"EXTRACTING THE MOST UNBLIASED KINETIC SCHEME FROM SINGLE MOLECULE TIME" "Bio-inspired approaches:Micro- & Nano- Architectures, Materials & Imaging"
FRANCE-JAPAN WORKSHOP(10.11-10.12 ,2011), Institut Europeen de Chimie et Biologie - Bordeaux (poster)

[31]Chun-Biu Li, Tamiki Komatsuzaki
Data-driven modeling of the complex dynamics and kinetics of single motor protein
17th International Biophysics Congress(10.30-11.3 ,2011) (poster)

[30]Yutaka Nagahata, Shinnosuke Kawai, Hiroshi Teramoto, Chun-Biu Li, Tamiki Komatsuzaki
Deterministic properties of a saddle with two reactive degrees-of-freedoms
12th RIES-Hokudai International Symposium (11.21-11.22 ,2011), Chateraise Gateaux Kingdom Sapporo (poster)

[29]Naoki Miyagawa, Hiroshi Teramoto, Chun Biu Li, Tamiki Komatsuzaki
Extracting many-body interaction laws from an observation
12th RIES-Hokudai International Symposium (11.21-11.22 ,2011), Chateraise Gateaux Kingdom Sapporo (poster)

2010

[28]Tamiki Komatsuzaki, Chun-Biu Li, Akinori Baba
Extracting Complex Network and Effective Free Energy Landscape of Protein Fluctuation From Single Molecule Time Series
Biophysical Society 54th Annual Meeting(2.10-2.24 ,2010), San Francisco,Calofornia, 20-24 (poster)

[27]Chun Biu Li, Haw Yang, Tamiki Komatsuzaki
Extracting and Quantifying the Multiscale Complex Networks Constructed from Single-Molecule Time Series
International Symposium on Joint Research Network on Advanced Materials and Devices 'Chou'(3 ,2010), Tomakomai, Hokkaido (poster)

[26]Tamiki Komatsuzaki, Chun Biu Li, Shinnosuke Kawai
Robustness and diversity of transitions in a sea of chaos and stochastic fluctuation
International Conference of Numerical Analysis and Applied Mathematics(9.19-9.25 ,2010), Greece (invited)

2009

[25]K. Sei, C. Li, T. Nomura, H. Tatsumi, T. Komatsuzaki
Data-driven time series analysis of Mechanosensitive ion channel gating dynamics
6th Asian Biophysics Association (ABA) Symposium & 27th Hong Kong Society of Neuroscience Annual Meeting(1 ,2009), Hong Kong, China (poster)

[24]C. Li
Complex multi-scale networks of protein fluctuation dynamics from single-molecule time series
6th Asian Biophysics Association (ABA) Symposium & 27th Hong Kong Society of Neuroscience Annual Meeting(1 ,2009), Hong Kong, China

[23]Chun Biu Li
Multiscale Networks of Interacting Biological Systems: From network constructions to causality among them
Sapporo Winter School(2.10-2.14 ,2009), Hokkaido University (poster)

[22]Kazuto Sei, Chun Biu Li, Tamiki Komatsuzaki
Time series analysis of mechanosensetive ion channel dynamics
International Symposium on Reaction Dynamics of Many-Body Chemical systems(6.22-6.24 ,2009), Kyoto Univ. (poster)

[21]Chun Biu Li, Mikito Toda, Tamiki Komatsuzaki
Does No-return Transition State always exist above the Reaction Threshold?
International Symposium on Reaction Dynamics of Many-Body Chemical systems(6.22-6.24 ,2009), Kyoto Univ. (poster)

[20]Chun Biu Li
Data-driven Multiscale Modeling of Single Molecule Experiments from Time Series Analysis
International Symposium 'Innovative Nanoscience of Supermolecular Motor Proteins'(9.8-9.10 ,2009), Kyoto (poster)

2008

[19]Li Chun Biu, Tamiki Komatsuzaki
Capturing the Multiple-Time-Scale Dynamical State-Space-Network in the Time Series of Single Molecule Experiment
1st Annual Protein and Peptide Conference(4.22-4.24 ,2008), Shenzhen (poster)

[18]Chun Biu Li
On the search of new mathematical frameworks to unveil the multiscale dynamics of complex systems
Workshop on Interfacial dynamics on the boundaries of physics, chemistry, biology and mathematics(11.20 ,2008), Hokkaido (invited)

[17]Chun Biu Li
Data-driven Modeling of Single Mechanosensitive Ion Channels from Time Series Analysis
Institute for Protein Research Seminar on New Approaches to Complexity of Protein Dynamics by Single Molecule Measurements: Experiments and Theories(12.7-12.9 ,2008), Osaka (invited talk)

[16]Kazuto Sei, Li Chun Biu, Tamiki Komatsuzaki
Toward the understanding of the gating dynamics for the mechanosensitive ion channel
Institute for Protein Research Seminar on New Approaches to Complexity of Protein Dynamics by Single Molecule Measurements: Experiments and Theories(12.7-12.9 ,2008), Osaka (poster)

2007

[15]Chun Biu Li
Detection of Phase Space Geometrical Structure Buried in Time Series
DYNAMICS OF COMPLEX SYSTEMS  - mathematical modeling, method and prediction -(on the celebration of 60th birthday of Profs. Y. Pesin and Y. Takahashi)(3.19-3.20 ,2007), Hokkaido University, Hokkaido, Japan (contributed talk)

[14]Akira Shojiguchi, Chun-Biu Li, Tamiki Komatsuzaki, Mikito Toda
Fractional behavior in Hamiltonian Chaos Describing Reactions
THE THIRD SHANGHAI INTERNATIONAL SYMPOSIUM ON NONLINEAR SCIENCES AND APPLICATIONS(6.6-6.11 ,2007), Shanghai, China (contributed talk)

[13]Chun Biu Li, Akira Shojiguchi, Mikito Toda, Tamiki Komatsuzaki
The Dynamical Origin of Chemical Reactions: How and Why Systems can React from One State to the Other
THE THIRD SHANGHAI INTERNATIONAL SYMPOSIUM ON NONLINEAR SCIENCES AND APPLICATIONS(6.6-6.11 ,2007), Shanghai, China (contributed talk)

[12]Chun-Biu Li, Tamiki Komatsuzaki
Extracting Protein Conformational Dynamics on a Photon-by-Photon Basis in Single Molecule Experiments
THE THIRD SHANGHAI INTERNATIONAL SYMPOSIUM ON NONLINEAR SCIENCES AND APPLICATIONS(6.6-6.11 ,2007), Shanghai, China (contributed talk)

[11]Yasuhiro Matsunaga, Chun-Biu Li, Tamiki Komatsuzaki
Anomalous Diffusion in Folding Dynamics of Minimalist Protein Landscape
THE THIRD SHANGHAI INTERNATIONAL SYMPOSIUM ON NONLINEAR SCIENCES AND APPLICATIONS(6.6-6.11 ,2007), Shanghai, China (contributed talk)

[10]Li Chun Biu, Tamiki Komatsuzaki
Capturing the multiple-time-scale dynamical state-network in the time series of single molecule experiments
ACS National Meeting: Single Molecule Spectroscopy, Imaging and Manipulation of Biomolecular Systems(8.19-8.23 ,2007), Boston (poster)

2006

[9]Chun Biu Li, Tamiki Komatsuzaki
Extracting Dynamics from Time Series Data of Single Molecule Experiments on a Photon-by-Photon Basis
Fifth East Asian Biophysics Symposium & Forty-Fourth Annual Meeting of the Biophysical Society of Japan(11.12-11.16 ,2006), Okinawa

[8]Chun Biu Li, Tamiki Komatsuzaki
Extracting Protein Conformational Dynamics on a Photon-by-Photon Basis in Single Molecule Electron Transfer
Discussion on "Theory and simulation of biomolecular nano-machines"URL(12.12-12.16 ,2006), Maiko Villa, Kobe (poster)

2005

[7]Chun Biu Li, Yasuhiro Matsunaga, Mikito Toda, Tamiki Komatsuzaki
Geometrical Structure of Phase Space for Chemical Reaction Dynamics: What Kinds of Molecular Motions are Associated with Phase Space Modes in Chaos?
International Symposium on Atoms, Molecules, and Clusters in Intense Laser Fields 2 (1.24-1.25 ,2005), Tokyo (poster)

[6]Yasuhiro Matsunaga, Chun Biu Li, Tamiki Komatsuzaki
Time series analysis of collective motions in proteins
Telluride Summer Workshop "Energy Landscapes: Dynamics and Optimization"(7.24-8.6 ,2005), Telluride, Colorado USA (contributed talk)
organized by David J. Wales(Univ. of Cambridge),Christian Shoen (MPI) and Karl H. Hoffmann (TU Chemnitz),

[5]Chun Biu Li, Mikito Toda, Tamiki Komatsuzaki
Origin of Stochastic Transition on Multi-dimensional Energy Landscape
Telluride Summer Workshop "Energy Landscapes: Dynamics and Optimization"(7.24-8.6 ,2005), Telluride, Colorado USA (contributed talk)
organized by David J. Wales(Univ. of Cambridge),Christian Shoen (MPI) and Karl H. Hoffmann (TU Chemnitz),

[4]Chun Biu Li, Mikito Toda, Tamiki Komatsuzaki
Vibrational energy redistribution via geometrical structures in the multi-dimensional phase space of chemical reaction
Telluride Summer Workshop "Condensed Phase and Gas Phase Vibrational Dynamics"URL( ,2005), Telluride, Colorado USA 8, 6-13 (contributed talk)
organized by David M. Leitner (Univ. of Nevada) and Peter Hamm (University of Zurich),

[3]Chun Biu Li, Tamiki Komatsuzaki
Dynamical Hierarchy in Transitions of Chemical Reactions
International Symposium on Ultrafast Intense Laser Science 4HP(12.10-12.14 ,2005), Big Island, Hawaii

[2]Chun Biu Li, Yasuhiro Matsunaga, Mikito Toda, Tamiki Komatsuzaki
Geometrical structure of the multidimensional phase space transport in chemical reactions
Pacifichem 2005HP(12.15-12.20 ,2005), Honolulu, Hawaii

2004

[1]Chun Biu Li
Multi-dimensional reaction dynamics in chaotic chemical process
Workshop on "Chaos and Nonlinear Dynamics in Quantum-Mechanical and Macroscopic Systems" (12.8-12.10 ,2004), Kyoto (poster)

担当授業科目

学部

  • 外国語演習:Introduction to Time Series Analysis with Applications to Real Complex System

大学院前期

  • ナノテクノロジー・ナノサイエンス概論I(分担)

大学院後期

所属学会

  • Member, American Physical Society
  • 日本生物物理学会